陈润生院士是我国最早从事理论生物学、生物信息学以及非编码RNA研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究，曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识，曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。构建了收录非编码RNA及其基因的数据库NONCODE，以及收录非编码RNA与其它生物大分子相互作用的数据库NPInter，这两个数据库也已成为了国际在非编码RNA领域非常有影响力的数据库。共发表SCI学术论文200余篇，自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告二十余次。由于其在基因组信息学领域的早期工作，1996年9月29日至10月3日在日本筑波召开的第十五届国际科学技术数据委员会（CODATA）大会上应邀作“Kotani Memorial Lecture”，同时获得“小谷正雄”奖（“Kotani Prize”，生物领域）。2008年获何梁何利基金科学与技术进步奖；2012年获谈家桢生命科学成就奖；2013年获得国家科学技术进步奖二等奖（第一完成人）。